More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0844 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 100 aa  204  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  47.96 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  54 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  48.48 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  46.88 
 
 		 99 aa  87  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  47.96 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  42.55 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  47.37 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  44.33 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  41.24 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  46 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  46.94 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  41.24 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  45.92 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  41.94 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1149  Ribosomal protein L25/L23  39.18 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000523481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  46.08 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  40.82 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  40.82 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  44.9 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  44 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  38.95 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  42.57 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  42.71 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  38.3 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  39.58 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  44.09 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  43 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  42.42 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  45.45 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  40.4 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  40.62 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  38.14 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  38.14 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  41.94 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  38.38 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  43.37 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  42.7 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  40.21 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  41 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  40.78 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  39.8 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  46.94 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  40.4 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  37.37 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  37.37 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  44.71 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  40.4 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  44.14 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  38.38 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  40.4 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  38.61 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  40.86 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  40.4 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  41.58 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  45.45 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  41.38 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  45.12 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  41.38 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>