More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4345 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 95 aa  184  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  63.83 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  58.51 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  53.68 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  43.62 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  47.83 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  51.81 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  48.91 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  41.94 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  45.98 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  39.56 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  45.65 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  40.43 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  43.68 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  43.48 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  50.57 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  44.68 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  43.01 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  49.41 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  40.66 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  41.76 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  43.96 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  40.43 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  41.9 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  39.56 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>