More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0453 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  97.87 
 
 
94 aa  189  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  95.74 
 
 
94 aa  185  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
94 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  44.79 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  42.11 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
91 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
91 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  41.41 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
91 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 
94 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  40.43 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  40.43 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  42.55 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  42.11 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  44.83 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  37.63 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  39.81 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  42.7 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  44.83 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  43.68 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  41.94 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
100 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
100 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  39.78 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  36.56 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  43.33 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  37.23 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  43.88 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  42.39 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  40.23 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  37.36 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  42.05 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  37.63 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  39.33 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 
104 aa  67  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  42.71 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  39.33 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  37.63 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  38.89 
 
 
98 aa  66.6  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3017  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000878321  decreased coverage  0.0020306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  42.22 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  41.38 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  39.77 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  39.33 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0278  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000301066  normal  0.113282 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  39.56 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3774  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3480  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000357625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3066  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3802  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00374922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  42.7 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3295  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000040814  hitchhiker  0.0000223362 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3744  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000010751  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2948  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000296107  hitchhiker  0.000000753496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3167  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145787  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>