More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1849 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  80.58 
 
 
103 aa  170  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  73.79 
 
 
103 aa  159  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  71.84 
 
 
103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  72.82 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  62.75 
 
 
109 aa  133  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  61.76 
 
 
109 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
97 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
97 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  48.35 
 
 
99 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
99 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
99 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 
101 aa  83.6  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  47.52 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 
100 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  48.86 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
94 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
98 aa  80.1  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  47.78 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  51.04 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08870  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.679116  hitchhiker  0.00894178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0839  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 
94 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  40.62 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0407  50S ribosomal protein L23P  43.48 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000028308  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0339  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150967  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  52.69 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1852  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000651916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2322  ribosomal L23 protein  43.16 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  42.39 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  42.42 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 
95 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  42.86 
 
 
99 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  42.7 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  42.7 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0281  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000926616  hitchhiker  0.00000149946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
100 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  44.57 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  48.39 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  44.9 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>