More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5156 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5156  ROK family protein  100 
 
 		 304 aa  614  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00561428  normal  0.212192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3960  ROK family protein  69.67 
 
 		 302 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  39.8 
 
 		 302 aa  218  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  34.76 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2015  ROK family protein  36.04 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  33.66 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  34.19 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  34.19 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.39 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.14 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.14 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.79 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0335  ROK family protein  34.16 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  30.46 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  32.39 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  31.06 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.58 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2241  ROK family protein  31.14 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.13 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.48 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0225  glucokinase, putative  34.25 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.74 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  33.13 
 
 		 328 aa  115  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2372  ROK family protein  32.41 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  29.9 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  31.29 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.39 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  29.24 
 
 		 321 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  31.19 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  30.18 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  29.55 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.71 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  31.78 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  29.11 
 
 		 321 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  30.28 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.65 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.75 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  29.97 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  32.49 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  30.6 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.62 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  30.26 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1025  sugar kinase  32.79 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0410056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  31.11 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  31.11 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  31.03 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  28.39 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0199  glucokinase, putative  30.86 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  28.14 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  28.97 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  28.89 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  29.27 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  33.66 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.76 
 
 		 402 aa  99.8  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.35 
 
 		 320 aa  99.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  30.66 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  27.3 
 
 		 325 aa  98.2  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  25.8 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  30.23 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  33.12 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  30.72 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  25.59 
 
 		 278 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  30.98 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  28.03 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.16 
 
 		 395 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.71 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  30.67 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  30 
 
 		 321 aa  95.5  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  28.2 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.8 
 
 		 405 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.44 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  29.6 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  28.2 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  28.09 
 
 		 408 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  31.58 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  30.28 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  28.09 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.3 
 
 		 408 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 405 aa  93.2  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  27.5 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  28.38 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.8 
 
 		 434 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  29.84 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  29.58 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  26.85 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.01 
 
 		 410 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  27.76 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  28.33 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0926  sugar kinase  31.83 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.83 
 
 		 407 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  28.12 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  28.33 
 
 		 280 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  28 
 
 		 406 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  25.55 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  26.71 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  23.49 
 
 		 408 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 		 404 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  30.74 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  26.78 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  28.75 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>