More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3020 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3020  histidine kinase  100 
 
 
1282 aa  2627    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883771  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2197  two-component sensor histidine kinase (sensor protein AtoS)  29.48 
 
 
1234 aa  504  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.993549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  26.67 
 
 
1230 aa  327  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  27.53 
 
 
1255 aa  326  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  34.93 
 
 
1347 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  33.02 
 
 
471 aa  224  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  36.87 
 
 
470 aa  221  8.999999999999998e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  33.01 
 
 
484 aa  214  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
594 aa  152  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  33.08 
 
 
581 aa  146  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
581 aa  146  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
581 aa  140  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  32.45 
 
 
573 aa  134  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
710 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
734 aa  132  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
744 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1110  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
508 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230539  normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
756 aa  129  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
752 aa  129  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
708 aa  127  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1130  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
525 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.351901  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
639 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
733 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
749 aa  123  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
756 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1199  histidine kinase  35.42 
 
 
525 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.893151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  29.6 
 
 
712 aa  121  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  28.41 
 
 
499 aa  121  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
731 aa  121  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
752 aa  119  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1071  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
498 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
640 aa  119  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
762 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
372 aa  119  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
763 aa  119  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
725 aa  119  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
610 aa  118  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
494 aa  118  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  26.82 
 
 
517 aa  118  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
757 aa  118  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
760 aa  118  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
756 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
641 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
639 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
639 aa  116  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
492 aa  116  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
784 aa  116  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
756 aa  115  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
559 aa  115  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
756 aa  115  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
736 aa  115  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
761 aa  115  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
518 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
764 aa  115  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
764 aa  115  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  27.63 
 
 
705 aa  115  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
733 aa  115  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
737 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.41 
 
 
747 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.41 
 
 
747 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.67 
 
 
748 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
469 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
769 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
480 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
745 aa  113  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  28.53 
 
 
487 aa  113  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  29.75 
 
 
734 aa  112  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  29.01 
 
 
484 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
491 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
753 aa  112  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  29.23 
 
 
496 aa  112  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
729 aa  112  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
816 aa  110  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
779 aa  110  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
799 aa  110  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.68 
 
 
747 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  28.94 
 
 
500 aa  109  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
755 aa  109  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  27.19 
 
 
742 aa  109  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
768 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  31.47 
 
 
714 aa  108  5e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
505 aa  108  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  29.22 
 
 
759 aa  108  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.21 
 
 
752 aa  108  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
753 aa  108  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
488 aa  107  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
753 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  28.09 
 
 
484 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
748 aa  107  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
762 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
742 aa  107  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
754 aa  107  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
476 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
738 aa  107  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
718 aa  106  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
498 aa  107  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
765 aa  107  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
773 aa  107  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  30 
 
 
766 aa  106  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0593  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
776 aa  106  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>