More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3006 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 324 aa  662    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  77.16 
 
 		 326 aa  521  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  63.69 
 
 		 326 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  63.19 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  65.42 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  62.7 
 
 		 311 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  63.84 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  63.12 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  53.11 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  49.07 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  49.07 
 
 		 324 aa  328  7e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  48.14 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  47.2 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  47.52 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  46.27 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  46.58 
 
 		 324 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  42.47 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  38.76 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.85 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  41.79 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.73 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  38.17 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  38.11 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  39.18 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  38.83 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  39.18 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  37.11 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  37.46 
 
 		 335 aa  212  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  37.15 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  35.67 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  36.83 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.87 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  36.31 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  36.11 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  38.75 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  36 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  36.22 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  37.46 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  36.89 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  35.44 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  37.8 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  35.35 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  34.67 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  35.03 
 
 		 336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  35.35 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  38 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  39.67 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  34.47 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  37.14 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  35.35 
 
 		 336 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  39.67 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.62 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  38.56 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  34.97 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  38.24 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  37.97 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  37.97 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.64 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  37.97 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0508  polyprenyl synthetase  38.2 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000945867  normal  0.644632 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0483  trans-hexaprenyltranstransferase  38.2 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000223454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  37.66 
 
 		 322 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  37.78 
 
 		 325 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  40.66 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  37.81 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  34.67 
 
 		 331 aa  195  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  38.08 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524  octaprenyl-diphosphate synthase  38.08 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0921642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  38.08 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  38.08 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3257  octaprenyl-diphosphate synthase  38.08 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.98 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  38.08 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  33.97 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  34.89 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  36.76 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  38.08 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  35.51 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  34.89 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.18 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1139  octaprenyl-diphosphate synthase  37.77 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0550  polyprenyl synthetase  37.89 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400591  normal  0.0346751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0098  trans-hexaprenyltranstransferase  37.89 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478178  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2803  polyprenyl synthetase  39.05 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000673013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35.4 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0580  trans-hexaprenyltranstransferase  37.89 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  34.91 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  38.21 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  36.22 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3665  trans-hexaprenyltranstransferase  37.89 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000484392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  34.82 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  37.96 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  41 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  35.46 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>