71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2695 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  342  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  30.97 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  31.69 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  29.25 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  27.64 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  29.6 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  31.9 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  33.05 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  29.92 
 
 
127 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  30.07 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  32.64 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  29.46 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  28.93 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  32.26 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  27.27 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  25.83 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  32.12 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  31.03 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  31.03 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  30.17 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  25.93 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  24.56 
 
 
149 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  28.12 
 
 
191 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  23.33 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  25.83 
 
 
138 aa  58.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  29.66 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  26.67 
 
 
175 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  28.17 
 
 
190 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  28.46 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  27.46 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  22.88 
 
 
150 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  30.08 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  26.77 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  26.98 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  26.87 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  21.37 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  26.89 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  25.47 
 
 
143 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  25.51 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  25.35 
 
 
145 aa  50.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  28.26 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  27.12 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2238  hypothetical protein  27.93 
 
 
128 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000319661  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  24.6 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3894  hypothetical protein  25.22 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  24.31 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  23.33 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  29.13 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  23.94 
 
 
143 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  23.94 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  24.81 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  36.05 
 
 
126 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  24.81 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  32.76 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  24.81 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  25.89 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  26.61 
 
 
136 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  32.47 
 
 
136 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  34.88 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  22.06 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  22.06 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  24.47 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  21.77 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  34 
 
 
109 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  22.58 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  24.79 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  23.81 
 
 
156 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2596  hypothetical protein  22.11 
 
 
95 aa  41.2  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292698  normal  0.0948228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  21.09 
 
 
135 aa  40.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>