More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2348 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2348  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 384 aa  784    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.555804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5613  protein of unknown function DUF214  61.08 
 
 		 388 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  25.95 
 
 		 869 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.75 
 
 		 807 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  26.06 
 
 		 821 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.66 
 
 		 813 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 788 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  24.51 
 
 		 804 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  24.44 
 
 		 831 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  25.15 
 
 		 810 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.92 
 
 		 846 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.77 
 
 		 915 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  22.49 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  24.92 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.56 
 
 		 807 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 		 784 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  23.96 
 
 		 802 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.47 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.54 
 
 		 642 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 803 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.26 
 
 		 816 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5378  ABC transporter permease protein  23.58 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 		 805 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4950  ABC transporter, permease  26.02 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  26.02 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5426  ABC transporter, permease  26.02 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  24.86 
 
 		 845 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  23.5 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  24.76 
 
 		 814 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.32 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.41 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  25.54 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.707712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.25 
 
 		 849 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  23.82 
 
 		 796 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  25.59 
 
 		 805 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  26.32 
 
 		 644 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5372  ABC transporter, permease protein  24.84 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  22.34 
 
 		 801 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  25.16 
 
 		 657 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.88 
 
 		 640 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  27.31 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  22.67 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  22.97 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  22.67 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  21.92 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  23.8 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  29.46 
 
 		 649 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4935  ABC transporter, permease  24.7 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.42 
 
 		 855 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.82 
 
 		 882 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.25 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  26.74 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  24.75 
 
 		 806 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  23.72 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  23.72 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  25.56 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  25.67 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 790 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  21.41 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1329  hypothetical protein  24.61 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.25 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0127  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  22.59 
 
 		 802 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  25.72 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  24.55 
 
 		 803 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  25.31 
 
 		 816 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  26.64 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  26.87 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  23.68 
 
 		 646 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 		 770 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.02 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  27 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.17 
 
 		 823 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  26.33 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  24.63 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  25.08 
 
 		 804 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  25.09 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  22.95 
 
 		 808 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.67 
 
 		 913 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  28.21 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  22.6 
 
 		 668 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  22.6 
 
 		 668 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 		 798 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  21.77 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  29.2 
 
 		 653 aa  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 793 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>