More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
540 aa  1053    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  51.04 
 
 
533 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  48.79 
 
 
531 aa  392  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  55.75 
 
 
562 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  51.27 
 
 
518 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  46.44 
 
 
533 aa  355  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  52.7 
 
 
540 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  53.19 
 
 
543 aa  353  4e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.71 
 
 
538 aa  353  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  47.29 
 
 
530 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  47.22 
 
 
538 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  55.69 
 
 
540 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  60.53 
 
 
407 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.61 
 
 
535 aa  335  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.24 
 
 
544 aa  334  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
537 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.04 
 
 
394 aa  331  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.72 
 
 
538 aa  329  8e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.06 
 
 
545 aa  327  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.23 
 
 
538 aa  327  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 
623 aa  325  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  45.62 
 
 
583 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  40.93 
 
 
545 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.03 
 
 
542 aa  311  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.07 
 
 
528 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.89 
 
 
546 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.37 
 
 
544 aa  280  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  50.45 
 
 
347 aa  277  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 
542 aa  276  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 
550 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.05 
 
 
529 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
532 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.94 
 
 
522 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.75 
 
 
547 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.48 
 
 
531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 
545 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.95 
 
 
904 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.89 
 
 
523 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.22 
 
 
535 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  50.47 
 
 
540 aa  243  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
538 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  45.91 
 
 
535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
526 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.4 
 
 
858 aa  230  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 
524 aa  226  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.94 
 
 
545 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.97 
 
 
1150 aa  223  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.41 
 
 
536 aa  223  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
539 aa  219  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.55 
 
 
530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  51.97 
 
 
965 aa  216  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.36 
 
 
715 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  33.39 
 
 
563 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 
562 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 
566 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.94 
 
 
702 aa  204  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
656 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 
563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.87 
 
 
566 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.7 
 
 
676 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 
562 aa  199  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 
686 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.91 
 
 
558 aa  196  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  39.78 
 
 
691 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  40.38 
 
 
563 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  40.06 
 
 
565 aa  194  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.46 
 
 
730 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 
397 aa  193  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 
572 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  38.29 
 
 
691 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  33.12 
 
 
565 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 
712 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.44 
 
 
563 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  41.05 
 
 
669 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 
561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.45 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 
688 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  42.23 
 
 
515 aa  189  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 
561 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 
563 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.81 
 
 
650 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 
561 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 
566 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 
568 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 
563 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
731 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.67 
 
 
688 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
656 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.63 
 
 
691 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  39.9 
 
 
697 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.17 
 
 
533 aa  187  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 
711 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.51 
 
 
449 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 
730 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 
563 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
573 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.27 
 
 
675 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
567 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 
563 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>