251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  100 
 
 
196 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  64.29 
 
 
187 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.54 
 
 
186 aa  236  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.71 
 
 
187 aa  235  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.24 
 
 
187 aa  234  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  63.27 
 
 
187 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.67 
 
 
187 aa  223  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  47.45 
 
 
188 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  47.45 
 
 
188 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  47.45 
 
 
188 aa  184  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  46.94 
 
 
199 aa  184  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  65.13 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.67 
 
 
190 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  38.97 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.1 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  41.62 
 
 
190 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  34.72 
 
 
189 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.24 
 
 
188 aa  118  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.06 
 
 
188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.82 
 
 
199 aa  111  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.44 
 
 
185 aa  107  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.72 
 
 
176 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 
176 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 
188 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  37.71 
 
 
176 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.47 
 
 
188 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  36.18 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  34.02 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  34.72 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
193 aa  94.7  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 
188 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.71 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34.01 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.64 
 
 
182 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
189 aa  91.3  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  36.53 
 
 
177 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.5 
 
 
185 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 
191 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.5 
 
 
178 aa  88.2  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  34.33 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.71 
 
 
181 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.02 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  30.57 
 
 
182 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  27.98 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  32.66 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.23 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4799  hypothetical protein  66.67 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  0.138579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.98 
 
 
194 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.69 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.14 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.98 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.85 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  27.27 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.14 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  30.89 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.59 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.77 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.88 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.96 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  30.39 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.84 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.56 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  29.08 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.5 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.39 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.93 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.46 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  24.1 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  32.34 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.36 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.53 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.13 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.13 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  26.02 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  27.04 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  34.13 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  25.37 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  30.39 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  29.38 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.86 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.08 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  27.14 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  32.31 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>