More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18350  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
263 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.525496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1903  alpha/beta hydrolase fold protein  51.3 
 
 
270 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000527486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3106  alpha/beta hydrolase fold protein  42.8 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.251532  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1973  alpha/beta hydrolase fold  46.44 
 
 
243 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3592  alpha/beta fold family hydrolase  31.8 
 
 
271 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3492  alpha/beta fold family hydrolase  31.8 
 
 
271 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000132504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3877  alpha/beta fold family hydrolase  31.8 
 
 
271 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  30.65 
 
 
271 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3759  hydrolase, alpha/beta fold family  31.8 
 
 
271 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000154361 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1452  hydrolase, alpha/beta fold family  30.38 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000259756 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3504  alpha/beta fold family hydrolase  31.42 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3779  alpha/beta fold family hydrolase  32.16 
 
 
271 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.385884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1030  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
272 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0308  alpha/beta fold family hydrolase, putative  29.85 
 
 
272 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03006  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13070)  32.08 
 
 
321 aa  129  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal  0.258218 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0117  alpha/beta hydrolase  30.5 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1827  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3348  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
265 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  34.65 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.71 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0638  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
293 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.925346  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  23.83 
 
 
571 aa  68.9  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.83 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.06 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  37.71 
 
 
350 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
346 aa  63.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 
300 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  29.13 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  22.89 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  29.41 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.9 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
387 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  31.56 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
387 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 
327 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  27.74 
 
 
387 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
330 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  23.6 
 
 
296 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2002  hypothetical protein  43.02 
 
 
154 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.711361  decreased coverage  0.000340708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  28.79 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
322 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.46 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
327 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
327 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  23.42 
 
 
318 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
308 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  23.6 
 
 
296 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  23.6 
 
 
296 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  36.23 
 
 
350 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.82 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
327 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  23.22 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  37.4 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 
325 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  25.23 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.22 
 
 
370 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.31 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
339 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
316 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  23.29 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
339 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>