More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  100 
 
 		 310 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  69.71 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  69.31 
 
 		 312 aa  362  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  68.79 
 
 		 312 aa  348  9e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2185  ABC-3 protein  68.18 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0841161 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  59.34 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  50.34 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  54.14 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  51.88 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  52.3 
 
 		 277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  51.19 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  49.15 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  47.76 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  53.39 
 
 		 339 aa  218  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  47.48 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  49.82 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  42.16 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  42.07 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  36.19 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  33.93 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  34.96 
 
 		 264 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  36.08 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.09 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  32.83 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  32.83 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  32.83 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  32.83 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  33.83 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.83 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  34.59 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  35.66 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  32.34 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  31.71 
 
 		 277 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  39.62 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  34.25 
 
 		 280 aa  136  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.83 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  34.88 
 
 		 268 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  32.28 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.98 
 
 		 275 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  30.04 
 
 		 266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  30.98 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  30.98 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  30.14 
 
 		 269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  31.16 
 
 		 361 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  29.85 
 
 		 268 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  30.41 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  31.88 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  30.41 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  30.41 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  36.09 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.53 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  31.67 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 272 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  33.1 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.17 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  32.33 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  34.39 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.22 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  27.8 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  32.28 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  32.69 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.41 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.18 
 
 		 279 aa  123  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  35.14 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  28.72 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  28.94 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.07 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  28.88 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  29.85 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  34.12 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  30.69 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30.18 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  30.25 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  31.8 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  24.09 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.64 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  29.89 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.21 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.21 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  35.34 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.27 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18250  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.39 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.96 
 
 		 278 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>