More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
328 aa  650    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  63.47 
 
 
334 aa  360  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  58.77 
 
 
314 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  55.84 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  55.24 
 
 
333 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  52.49 
 
 
373 aa  289  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  51.14 
 
 
321 aa  289  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  45.91 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  51.96 
 
 
313 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  55.05 
 
 
345 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  47.43 
 
 
341 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  45.96 
 
 
334 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  43.9 
 
 
340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  46.53 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  46.22 
 
 
354 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  45.4 
 
 
339 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.32 
 
 
346 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  46.95 
 
 
332 aa  255  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  45.23 
 
 
338 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  56.68 
 
 
309 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.23 
 
 
323 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.51 
 
 
346 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.23 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  45.94 
 
 
308 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  43.93 
 
 
334 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.41 
 
 
338 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  42.24 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.29 
 
 
339 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  45.12 
 
 
346 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  43.56 
 
 
334 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.86 
 
 
338 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  47.06 
 
 
322 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.54 
 
 
336 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  41.99 
 
 
329 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  41.79 
 
 
334 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.6 
 
 
336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.3 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.3 
 
 
336 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.3 
 
 
336 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.99 
 
 
336 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.69 
 
 
336 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.69 
 
 
336 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.69 
 
 
336 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.18 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  42.64 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  42.09 
 
 
334 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  44.68 
 
 
338 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  44.68 
 
 
338 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.64 
 
 
339 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
322 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.41 
 
 
338 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  40.73 
 
 
378 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
340 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.92 
 
 
343 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.27 
 
 
339 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.33 
 
 
350 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.99 
 
 
395 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.58 
 
 
339 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.51 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
339 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
339 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  36.28 
 
 
352 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.55 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  35.84 
 
 
337 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  35.99 
 
 
323 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  36.45 
 
 
356 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  34.82 
 
 
323 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  34.48 
 
 
319 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  29.94 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  34.2 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
323 aa  139  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  29.11 
 
 
312 aa  135  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  33.54 
 
 
325 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  30.89 
 
 
316 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  31.13 
 
 
317 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  33.57 
 
 
309 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  32.19 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  28.72 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  31.41 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.15 
 
 
326 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.15 
 
 
326 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  28.15 
 
 
326 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  28.15 
 
 
326 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.15 
 
 
326 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  28.15 
 
 
326 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  25.33 
 
 
326 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.81 
 
 
326 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.18 
 
 
327 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1588  aldo/keto reductase  27.65 
 
 
302 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1557  aldo/keto reductase  27.65 
 
 
302 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  31.51 
 
 
324 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  27.08 
 
 
327 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  29.9 
 
 
331 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.74 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  27.96 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  30.84 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  27.59 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  30.32 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  29.73 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  28 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>