More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
347 aa  655    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  52.12 
 
 
518 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  50.88 
 
 
540 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  52.98 
 
 
545 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  55.28 
 
 
533 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.87 
 
 
545 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  51.48 
 
 
562 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.13 
 
 
528 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.15 
 
 
522 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  51.39 
 
 
543 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.72 
 
 
538 aa  268  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  50.59 
 
 
540 aa  268  8.999999999999999e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  50.3 
 
 
531 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  51.25 
 
 
538 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.29 
 
 
544 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  49.71 
 
 
542 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  50.3 
 
 
530 aa  259  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  52.22 
 
 
540 aa  255  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.06 
 
 
538 aa  252  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
537 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.38 
 
 
623 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  49.11 
 
 
535 aa  248  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.27 
 
 
538 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 
547 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.56 
 
 
904 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.83 
 
 
523 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  50.46 
 
 
533 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.18 
 
 
394 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 
542 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.05 
 
 
535 aa  235  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  51.09 
 
 
540 aa  235  7e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  47.06 
 
 
407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.21 
 
 
538 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
544 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.58 
 
 
546 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.08 
 
 
532 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
702 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.12 
 
 
526 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.32 
 
 
545 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.19 
 
 
1150 aa  218  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.37 
 
 
535 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.06 
 
 
715 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 
858 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 
545 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
531 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
536 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.6 
 
 
529 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
550 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  45.86 
 
 
583 aa  209  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 
524 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.95 
 
 
554 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.39 
 
 
573 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.89 
 
 
539 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.71 
 
 
530 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 
688 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.65 
 
 
397 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 
573 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  46.76 
 
 
533 aa  192  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  46.18 
 
 
965 aa  192  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
689 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 
535 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.08 
 
 
493 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 
688 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  39.19 
 
 
565 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.34 
 
 
567 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 
730 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  38.19 
 
 
566 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.8 
 
 
561 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 
563 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
712 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.77 
 
 
656 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20550  methyl-accepting chemotaxis protein  39.17 
 
 
733 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375054  normal  0.44591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.43 
 
 
650 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 
563 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 
563 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 
712 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 
688 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
669 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
563 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 
561 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.08 
 
 
730 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 
731 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  39.61 
 
 
697 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.92 
 
 
691 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.81 
 
 
574 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0260271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.18 
 
 
657 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 
566 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
563 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  37.43 
 
 
564 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.26 
 
 
561 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 
562 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 
515 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.79 
 
 
574 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
698 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 
559 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
563 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.17 
 
 
567 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 
558 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  44.11 
 
 
691 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 
566 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>