116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3809 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3809  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  234  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  74.04 
 
 
319 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  74 
 
 
325 aa  154  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  71 
 
 
325 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  72 
 
 
325 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  71 
 
 
325 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  72 
 
 
325 aa  150  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  72.16 
 
 
325 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  71 
 
 
325 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  69 
 
 
326 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  73.2 
 
 
325 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  70 
 
 
325 aa  148  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  72.16 
 
 
316 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  70.1 
 
 
325 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  70 
 
 
325 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  69 
 
 
325 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  68 
 
 
325 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  71 
 
 
198 aa  147  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  71 
 
 
198 aa  147  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  69 
 
 
325 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  72.16 
 
 
329 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  66 
 
 
325 aa  144  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  66 
 
 
325 aa  144  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  66 
 
 
325 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  66 
 
 
325 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  63.92 
 
 
325 aa  140  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  63.92 
 
 
325 aa  139  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  72.29 
 
 
104 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  56 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1889  hypothetical protein  76.62 
 
 
88 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  55.45 
 
 
326 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  54 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  54 
 
 
323 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  60.22 
 
 
325 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  54.55 
 
 
326 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  57.73 
 
 
325 aa  123  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  58 
 
 
326 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  58 
 
 
326 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  55.67 
 
 
325 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  55 
 
 
325 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  55.67 
 
 
325 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  55.67 
 
 
325 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  56.7 
 
 
325 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  59.14 
 
 
325 aa  120  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  55.67 
 
 
325 aa  120  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  54.64 
 
 
325 aa  120  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  54.64 
 
 
325 aa  120  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  55.67 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  53.61 
 
 
325 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  55.91 
 
 
325 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  49.53 
 
 
326 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  60.24 
 
 
325 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  48 
 
 
326 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  51.72 
 
 
198 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  65.33 
 
 
293 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  52.44 
 
 
370 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  50.57 
 
 
323 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  49.44 
 
 
341 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  47.06 
 
 
370 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  48.81 
 
 
327 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  48.81 
 
 
327 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  50 
 
 
327 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  44.71 
 
 
344 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  45.24 
 
 
344 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  48.24 
 
 
336 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  47.62 
 
 
327 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  47.62 
 
 
327 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  45.24 
 
 
344 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  44.05 
 
 
341 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  42.86 
 
 
349 aa  88.6  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  45.24 
 
 
341 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  42.86 
 
 
344 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  42.86 
 
 
344 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  41.05 
 
 
377 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  46.43 
 
 
327 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  40.48 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  44.05 
 
 
341 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.62 
 
 
325 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  40.48 
 
 
345 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  42.86 
 
 
341 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  43.62 
 
 
325 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.62 
 
 
208 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  43.62 
 
 
325 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  41.46 
 
 
347 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  41.46 
 
 
213 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  43.62 
 
 
325 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  43.62 
 
 
325 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  39.29 
 
 
344 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  43.9 
 
 
336 aa  83.6  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  43.62 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  42.55 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  42.55 
 
 
325 aa  82  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  44.19 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  39.53 
 
 
347 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  39.39 
 
 
325 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3678  hypothetical protein  63.64 
 
 
68 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>