More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1722 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  100 
 
 		 575 aa  1185    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  44.97 
 
 		 586 aa  498  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  46.09 
 
 		 585 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  45.27 
 
 		 522 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  41.53 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  43.97 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  44.14 
 
 		 228 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  46.04 
 
 		 226 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  46.04 
 
 		 226 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  45.54 
 
 		 226 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  45.05 
 
 		 226 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  45.88 
 
 		 202 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  43.65 
 
 		 236 aa  154  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  44.85 
 
 		 198 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  34.34 
 
 		 208 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 214 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  33.84 
 
 		 212 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  35.15 
 
 		 201 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  30 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 222 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  27.27 
 
 		 1287 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  26.35 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  26.85 
 
 		 192 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 196 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  26.42 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 200 aa  67  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  27.7 
 
 		 192 aa  67  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  28.1 
 
 		 196 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.37 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  28.48 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  26.74 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  26.74 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  27.4 
 
 		 202 aa  60.1  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  28.97 
 
 		 236 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 195 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 236 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  28.97 
 
 		 222 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  28.22 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  27.33 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  28.97 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  28.22 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.14 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  29.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  27.54 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  29.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  28.28 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  28.97 
 
 		 236 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 257 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 252 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.02 
 
 		 232 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 265 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  30.34 
 
 		 267 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 203 aa  55.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1267  methyltransferase type 12  32.21 
 
 		 350 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 201 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 305 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  27.91 
 
 		 246 aa  54.7  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  34.51 
 
 		 226 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.42 
 
 		 287 aa  55.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 201 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.58 
 
 		 231 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.41 
 
 		 232 aa  54.7  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 201 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 201 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 201 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 232 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 223 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 201 aa  53.9  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 252 aa  53.9  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  30.25 
 
 		 263 aa  53.9  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 199 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  28.1 
 
 		 207 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  24.11 
 
 		 248 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  31.75 
 
 		 292 aa  53.5  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  30.2 
 
 		 348 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 242 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  25.17 
 
 		 306 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 239 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 		 233 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  25.65 
 
 		 222 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  23.72 
 
 		 202 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 239 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 229 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>