More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3333 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 212 aa  440  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  71.78 
 
 		 212 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  78.69 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.97 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  35.5 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  35.5 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  35.5 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  35.18 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  36.97 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  36.63 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  35.5 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  33.82 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  36.56 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  37.64 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  36.6 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  37.08 
 
 		 203 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  33.91 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  33.91 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  31.86 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  35.45 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  30.69 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  33.5 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  35.75 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  30.84 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  29.8 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  29.65 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  31.41 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  32.95 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  31.13 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  31.19 
 
 		 193 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  37.08 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  36.17 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  37.72 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  35.64 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
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NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  33.72 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  33.9 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  31.66 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  31.66 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  31.66 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  31.66 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  31.66 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  31.4 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  35.85 
 
 		 181 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  35.85 
 
 		 181 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.4 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  34.19 
 
 		 202 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  30.81 
 
 		 197 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.4 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.19 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  38.35 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  34.19 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  35.22 
 
 		 181 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  29.9 
 
 		 187 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  32.56 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  30.51 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  29.89 
 
 		 185 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  27.04 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  38.61 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  41.44 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  32.97 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 		 197 aa  92.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  29.35 
 
 		 197 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  44.05 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 		 192 aa  91.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  30.23 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  27.57 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  28.26 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  29.86 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  30.39 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  27.75 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  29.49 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
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NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 296 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  30.81 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  31.61 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
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