More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2667 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  48.26 
 
 		 2016 aa  1813    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  66.6 
 
 		 1963 aa  2639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  67.54 
 
 		 1981 aa  2650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2667  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  100 
 
 		 1928 aa  3995    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.448913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  66.25 
 
 		 1979 aa  2607    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  67.2 
 
 		 1998 aa  2667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  70.93 
 
 		 1937 aa  2841    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  67.09 
 
 		 1981 aa  2643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  67.09 
 
 		 1976 aa  2627    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  65.53 
 
 		 1985 aa  2569    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  67.15 
 
 		 1989 aa  2657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1113  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  58.38 
 
 		 1899 aa  2177    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  67.79 
 
 		 1985 aa  2688    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  71.58 
 
 		 1946 aa  2829    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1686  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  49.55 
 
 		 1971 aa  1866    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  67.22 
 
 		 1989 aa  2662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  72.27 
 
 		 1951 aa  2877    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  67.54 
 
 		 1987 aa  2669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  36.1 
 
 		 2368 aa  576  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  32.48 
 
 		 2396 aa  447  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  29.95 
 
 		 2276 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.17 
 
 		 3073 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.74 
 
 		 2376 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.71 
 
 		 2348 aa  439  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.36 
 
 		 2336 aa  439  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  32.5 
 
 		 2882 aa  437  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  32.27 
 
 		 2391 aa  435  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2592  Beta-ketoacyl synthase  45.93 
 
 		 453 aa  417  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  30.24 
 
 		 2275 aa  408  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3915  beta-ketoacyl synthase  43.96 
 
 		 453 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  42.14 
 
 		 1605 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3953  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.13 
 
 		 775 aa  291  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0186337  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  35.56 
 
 		 2300 aa  273  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  34.99 
 
 		 2386 aa  273  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.06 
 
 		 1772 aa  270  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.12 
 
 		 2704 aa  267  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  34.33 
 
 		 2642 aa  267  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  34.12 
 
 		 2703 aa  267  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  34.26 
 
 		 2693 aa  268  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  33.54 
 
 		 2448 aa  267  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.12 
 
 		 2694 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  33.69 
 
 		 2620 aa  265  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 		 1764 aa  263  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  33.98 
 
 		 2624 aa  262  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  33.98 
 
 		 2640 aa  261  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  33.98 
 
 		 2657 aa  261  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  34.26 
 
 		 1413 aa  261  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  33.4 
 
 		 1272 aa  260  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  32.98 
 
 		 2664 aa  259  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  34.26 
 
 		 2531 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2930  Beta-hydroxyacyl dehydratase FabA/FabZ  38.12 
 
 		 987 aa  257  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000108157  normal  0.590292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  33.48 
 
 		 2298 aa  256  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  32.98 
 
 		 2619 aa  256  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.05 
 
 		 2661 aa  252  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.78 
 
 		 2750 aa  251  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  33.47 
 
 		 2338 aa  251  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  32.33 
 
 		 2542 aa  247  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.12 
 
 		 2477 aa  247  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.91 
 
 		 2443 aa  245  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  36 
 
 		 1109 aa  244  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.19 
 
 		 2683 aa  244  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  31.49 
 
 		 2327 aa  244  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  31.06 
 
 		 2189 aa  243  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  33.26 
 
 		 2314 aa  243  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  32.33 
 
 		 2764 aa  242  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.91 
 
 		 2771 aa  240  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.33 
 
 		 2249 aa  238  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  32.91 
 
 		 2560 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  33.96 
 
 		 2674 aa  236  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.66 
 
 		 2414 aa  233  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  31.62 
 
 		 3008 aa  232  5e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  27.18 
 
 		 3527 aa  229  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  33.87 
 
 		 3243 aa  229  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  31.09 
 
 		 2553 aa  226  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  33.78 
 
 		 2266 aa  226  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  32.06 
 
 		 1631 aa  225  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  33.4 
 
 		 3115 aa  225  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  33.4 
 
 		 2772 aa  225  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  34.69 
 
 		 1107 aa  224  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  33.61 
 
 		 2888 aa  224  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.98 
 
 		 2260 aa  221  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  31.93 
 
 		 1480 aa  216  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  34.18 
 
 		 2503 aa  215  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  31.61 
 
 		 3811 aa  215  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  29.78 
 
 		 2501 aa  212  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.29 
 
 		 2551 aa  211  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  32.64 
 
 		 2628 aa  210  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  31.73 
 
 		 1453 aa  207  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  30.39 
 
 		 1740 aa  207  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  31.38 
 
 		 2604 aa  207  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  30.66 
 
 		 1840 aa  207  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  29.56 
 
 		 2880 aa  206  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 		 2036 aa  206  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4001  Beta-ketoacyl synthase  31.93 
 
 		 2000 aa  206  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  33.12 
 
 		 1985 aa  205  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  29.05 
 
 		 3111 aa  205  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  26.28 
 
 		 2338 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  26.28 
 
 		 2287 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.48 
 
 		 1656 aa  204  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1116  putative polyketide synthase  26.28 
 
 		 2294 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>