More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2420 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  74.54 
 
 		 929 aa  1457    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  39.22 
 
 		 936 aa  705    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  75.51 
 
 		 929 aa  1481    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  74.11 
 
 		 929 aa  1441    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  78.49 
 
 		 929 aa  1560    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  46.45 
 
 		 904 aa  874    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 925 aa  1922    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  70.75 
 
 		 929 aa  1380    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  46.45 
 
 		 925 aa  889    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  47.45 
 
 		 939 aa  910    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  74.43 
 
 		 929 aa  1463    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  74.65 
 
 		 929 aa  1470    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  74.32 
 
 		 929 aa  1456    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  71.07 
 
 		 929 aa  1371    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  79.78 
 
 		 929 aa  1539    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  74.21 
 
 		 929 aa  1462    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  74.43 
 
 		 929 aa  1457    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  74.43 
 
 		 929 aa  1454    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  74.54 
 
 		 929 aa  1459    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  72.82 
 
 		 929 aa  1422    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  37.62 
 
 		 968 aa  632  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  34.94 
 
 		 945 aa  610  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  35.97 
 
 		 915 aa  598  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  34.44 
 
 		 947 aa  559  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  33.41 
 
 		 941 aa  542  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  33.15 
 
 		 963 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  30.81 
 
 		 1100 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  31.42 
 
 		 995 aa  432  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  29.87 
 
 		 958 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  30.11 
 
 		 982 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  29.13 
 
 		 962 aa  389  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  30.23 
 
 		 986 aa  389  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  29.19 
 
 		 946 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  28.52 
 
 		 1162 aa  384  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  30.06 
 
 		 967 aa  386  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  30.13 
 
 		 1074 aa  382  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  30.36 
 
 		 981 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  28.06 
 
 		 962 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  28.06 
 
 		 962 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  28.06 
 
 		 962 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  28.55 
 
 		 916 aa  369  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  29.5 
 
 		 962 aa  361  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  29.5 
 
 		 962 aa  361  4e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  29.28 
 
 		 962 aa  360  7e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  29.39 
 
 		 962 aa  360  9e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  29.39 
 
 		 962 aa  360  9e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  29.39 
 
 		 962 aa  360  9e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  29.28 
 
 		 962 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  29.28 
 
 		 962 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  29.28 
 
 		 962 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  27.35 
 
 		 1008 aa  353  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  28.13 
 
 		 962 aa  351  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  28.02 
 
 		 962 aa  350  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  28.1 
 
 		 962 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  28.02 
 
 		 962 aa  347  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  28.02 
 
 		 962 aa  343  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  27.78 
 
 		 960 aa  335  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  28.02 
 
 		 952 aa  323  6e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  34.72 
 
 		 1272 aa  249  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  25.21 
 
 		 939 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  33.12 
 
 		 762 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  30.63 
 
 		 808 aa  157  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  27.89 
 
 		 779 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  30 
 
 		 763 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  34.17 
 
 		 766 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  29.73 
 
 		 775 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.5 
 
 		 760 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.8 
 
 		 809 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  34.29 
 
 		 766 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  27.09 
 
 		 932 aa  121  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  32.33 
 
 		 1246 aa  120  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  30.35 
 
 		 843 aa  110  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  28.94 
 
 		 794 aa  110  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  23.83 
 
 		 419 aa  102  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  25 
 
 		 431 aa  102  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  23.57 
 
 		 419 aa  100  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  23.91 
 
 		 419 aa  99.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  30.92 
 
 		 453 aa  99.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  25.43 
 
 		 423 aa  95.1  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  29.05 
 
 		 441 aa  94  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  29.05 
 
 		 441 aa  94  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  28.88 
 
 		 513 aa  94  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  27.17 
 
 		 514 aa  94.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  30.52 
 
 		 461 aa  92.8  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  26.03 
 
 		 429 aa  92  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  26.34 
 
 		 436 aa  91.3  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  26.37 
 
 		 443 aa  91.3  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  30.36 
 
 		 443 aa  90.5  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  27.48 
 
 		 453 aa  90.1  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  26.19 
 
 		 463 aa  90.1  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  25.93 
 
 		 411 aa  90.1  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  23.5 
 
 		 431 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2243  peptidase M16 domain-containing protein  26.6 
 
 		 476 aa  90.1  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193562  normal  0.100659 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  27.31 
 
 		 440 aa  89  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  26.35 
 
 		 489 aa  89  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  26.4 
 
 		 448 aa  88.6  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  26.78 
 
 		 443 aa  88.6  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  30.41 
 
 		 441 aa  88.2  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  29.91 
 
 		 443 aa  88.6  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  25.45 
 
 		 472 aa  88.2  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>