168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06360 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  417  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  30.81 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  40.3 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  42.47 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  40.3 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  25.91 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18610  transcriptional regulator, tetR family  51.16 
 
 		 89 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  39.34 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  39.19 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0548  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 243 aa  48.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  40.68 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08810  hypothetical protein  38.71 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.239568 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0904  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  36.07 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  25.68 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  28.38 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>