More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1987 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 268 aa  554  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  58.91 
 
 		 287 aa  345  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  62.36 
 
 		 267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  322  5e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  49.62 
 
 		 269 aa  279  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  46.18 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  48.85 
 
 		 270 aa  274  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  45.98 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  47.89 
 
 		 267 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  46.36 
 
 		 267 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  47.71 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  45.98 
 
 		 267 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  46.54 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  46.95 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  46.74 
 
 		 288 aa  258  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  45.04 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  45.35 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  46.77 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  47.15 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  47.08 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  47.15 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  45.06 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  47.15 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  47.15 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  43.4 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  44.27 
 
 		 273 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  40.16 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 282 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  27.1 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.23 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  22.31 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  25.1 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  24.23 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  25.29 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  27.76 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  27.76 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  27.76 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  27.76 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  26.67 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  27.76 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  23.42 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  27.38 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  27.76 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  27.44 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  24.03 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  25.48 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  25.48 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  23.31 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  25.48 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  23.68 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.67 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  25.1 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  23.87 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.44 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  27 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  22.43 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  23.97 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  25.4 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  24.79 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  23.58 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  27.06 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  23.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  23.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  27.06 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  24.43 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  23.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.85 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  27.06 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.9 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  21.93 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  26.67 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  22.63 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  23.4 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  24.47 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  26.38 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  21.77 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  21.96 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  22.64 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  26.38 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.47 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>