285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1781 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  41.44 
 
 		 119 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  41.67 
 
 		 126 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  37.3 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  33.06 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  34.43 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  36.7 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 143 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  33.06 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  30.33 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  33.03 
 
 		 130 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0884  hypothetical protein  33.02 
 
 		 122 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  29.58 
 
 		 143 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  30.48 
 
 		 113 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  31.93 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  28.29 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  35.51 
 
 		 125 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  33.03 
 
 		 124 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  36.36 
 
 		 132 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  31.54 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  35.45 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  27.7 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  37.89 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  36.19 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  37.89 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1472  hypothetical protein  31.09 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  32.71 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  30.5 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.85 
 
 		 153 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  35.58 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  28.57 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.21 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.56 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  33.65 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  34.62 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  34.62 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  34.62 
 
 		 127 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2442  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  34.62 
 
 		 127 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  28.37 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 138 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 143 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  28.67 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 143 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 143 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  29.53 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  29.53 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  28.19 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.32 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  24.18 
 
 		 166 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.08 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  28.29 
 
 		 157 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.15 
 
 		 143 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 163 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  29.37 
 
 		 126 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  28.19 
 
 		 162 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.56 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.7 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 167 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  30.46 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2439  hypothetical protein  29.51 
 
 		 127 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1481  hypothetical protein  31.82 
 
 		 121 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  30.63 
 
 		 120 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  30.63 
 
 		 120 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  30.63 
 
 		 120 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 143 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  28.38 
 
 		 143 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  24.66 
 
 		 147 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  27.15 
 
 		 147 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.85 
 
 		 156 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 159 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 159 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  29.73 
 
 		 120 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  24.84 
 
 		 182 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  24.84 
 
 		 182 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  27.21 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.84 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  29.27 
 
 		 122 aa  52.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.89 
 
 		 142 aa  52.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  25.64 
 
 		 120 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  26 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.73 
 
 		 153 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  24.79 
 
 		 122 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>