15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0884 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0884  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  54.39 
 
 		 114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  33.02 
 
 		 285 aa  67  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  31.78 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  24.76 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  25.47 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  25.45 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  22.22 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  26.61 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  26.89 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  27.88 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  26.96 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  28.44 
 
 		 127 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>