41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0576 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  62.4 
 
 		 126 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  51.61 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  54.03 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  53.97 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  52.38 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  52.38 
 
 		 132 aa  140  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  50.4 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  49.6 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  50.79 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  51.59 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  51.59 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  51.59 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  51.59 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  51.59 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  45.6 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  32.26 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 285 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  32.69 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  27.88 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  28.97 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0884  hypothetical protein  24.76 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  30.69 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  23.23 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  29.91 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  31.19 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  23.23 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  29.73 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  26.36 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  29.73 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  29.73 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  29.73 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  27.52 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3627  hypothetical protein  26.88 
 
 		 103 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3965  hypothetical protein  26.88 
 
 		 103 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0238816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2439  hypothetical protein  27.43 
 
 		 127 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  30.93 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  30.39 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0110151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>