14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2439 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2439  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2442  UspA domain-containing protein  57.02 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  32.46 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  26.83 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  32.46 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  23.81 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  33.62 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  31.9 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  32.76 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  28.32 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  27.43 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  30.36 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  29.81 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>