36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3250 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  97.73 
 
 		 132 aa  260  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  96.21 
 
 		 132 aa  256  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  92.42 
 
 		 132 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  86.61 
 
 		 127 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  86.61 
 
 		 127 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  86.61 
 
 		 127 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  85.83 
 
 		 127 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  85.83 
 
 		 127 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  65.35 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  63.33 
 
 		 125 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  59.84 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  57.38 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  54.76 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  52.38 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  46.56 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  34.4 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  37.89 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  31.03 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  32.74 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  30.91 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  35.05 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  31.19 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  33.03 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2439  hypothetical protein  33.62 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  28.7 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  28.7 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  28.7 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  29.09 
 
 		 125 aa  43.5  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  28.3 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  30.93 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  28.7 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  27.59 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3965  hypothetical protein  27.96 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3627  hypothetical protein  27.96 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>