40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3102 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  256  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  66.13 
 
 		 125 aa  178  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  60.48 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  64.17 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  62.5 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  63.33 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  63.33 
 
 		 127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  63.33 
 
 		 127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  63.33 
 
 		 132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  62.5 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  62.5 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  59.17 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  52 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  54.84 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  54.03 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  46.4 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  35.2 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3965  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3627  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  28.7 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  29.47 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  23.68 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  34.58 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  36.08 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  24.24 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  32.71 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  28.97 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  28.7 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  28.7 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0884  hypothetical protein  25.45 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  26.36 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  30.43 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  30.43 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  30.43 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  30.43 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  28.28 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  28.43 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3783  hypothetical protein  26.42 
 
 		 162 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  29.46 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>