15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3783 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3783  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  333  7e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4166  hypothetical protein  52.1 
 
 
126 aa  147  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.25145  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  30.36 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  31.48 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  28.44 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  26.85 
 
 
130 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  26.79 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  22.94 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  25.44 
 
 
285 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  21.05 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  21.43 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  24.78 
 
 
121 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  22.03 
 
 
122 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  26.42 
 
 
125 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>