28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2630 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  247  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4166  hypothetical protein  47.32 
 
 
126 aa  116  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.25145  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  41.18 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  35 
 
 
120 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  32.5 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3783  hypothetical protein  30.36 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  29.66 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  25 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  30.33 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  24.58 
 
 
126 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  23.73 
 
 
127 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  29.75 
 
 
122 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  22.88 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  23.73 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  30.43 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  30.43 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  27.12 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  23.97 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  27.12 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  25.98 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  23.73 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 
285 aa  50.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  22.88 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  22.88 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  22.88 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  22.03 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  21.19 
 
 
120 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1472  hypothetical protein  24.14 
 
 
265 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>