33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1563 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  259  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  98.43 
 
 		 127 aa  254  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  96.06 
 
 		 127 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  88.8 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  68 
 
 		 125 aa  184  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  173  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  173  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  65 
 
 		 120 aa  170  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  48.76 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  47.62 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  42.15 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  35.25 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  29.66 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  28.33 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  30.83 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  29.63 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  23.73 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  25.98 
 
 		 285 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  26.85 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  26.45 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  19.49 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  25.42 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  28.93 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  25.62 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  24.79 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  24.79 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4166  hypothetical protein  22 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.25145  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  30.19 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  30.19 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  30.19 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2658  hypothetical protein  27.37 
 
 		 227 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>