26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1248 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  246  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4166  hypothetical protein  51.67 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.25145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  41.18 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  30.25 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  30.25 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  30.89 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  27.87 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  23.73 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  26.83 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  22.03 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  23.39 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  24.19 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  24.35 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  24.35 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  28.7 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  22.03 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  18.64 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  18.64 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  20.34 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  18.64 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  19.49 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  17.8 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  19.49 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  16.67 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  20.79 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>