31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1957 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  43.8 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  42.62 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  42.5 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  42.5 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  41.32 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  42.5 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  42.5 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  35.25 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  35.25 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  34.43 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  35.25 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  34.75 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  27.5 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  24.17 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  25.62 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  23.97 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  29.27 
 
 		 285 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  23.53 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  31.25 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  26.83 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  30.21 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  32.29 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  29.36 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  30.93 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  29.17 
 
 		 127 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  29.17 
 
 		 127 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>