13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3627 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  207  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3965  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  207  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  28.72 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  30.21 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 285 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  28.74 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  32.67 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  25.56 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  26.88 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  27.96 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>