31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2854 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  66.93 
 
 		 132 aa  188  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  66.14 
 
 		 132 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  65.35 
 
 		 132 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  66.14 
 
 		 127 aa  183  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  64.57 
 
 		 132 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  65.35 
 
 		 127 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  65.35 
 
 		 127 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  64.57 
 
 		 127 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  64.57 
 
 		 127 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  56.69 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  55.37 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  52 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  52.8 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  50.4 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  43.31 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  29.6 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  32.38 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  32.71 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  31.78 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  27.52 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3627  hypothetical protein  30.77 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3965  hypothetical protein  30.77 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0238816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  23.93 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  27.78 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  28.16 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  27.36 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  24.76 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  26.61 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2439  hypothetical protein  30.36 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>