32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1041 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  99.21 
 
 
127 aa  253  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  99.21 
 
 
127 aa  253  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  96.06 
 
 
127 aa  247  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  88.98 
 
 
132 aa  235  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  88.19 
 
 
132 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  86.61 
 
 
132 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  84.25 
 
 
132 aa  221  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  65.35 
 
 
127 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  63.33 
 
 
125 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  57.94 
 
 
125 aa  154  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  57.48 
 
 
126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  55.56 
 
 
126 aa  140  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  51.59 
 
 
126 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  45.67 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  30.4 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 
285 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  28.85 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  33.01 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  29.91 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  28.44 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  30.28 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  27.52 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  28.04 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
743 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  28.87 
 
 
122 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  27.36 
 
 
114 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  27.52 
 
 
120 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  26.13 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  25.96 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  24.35 
 
 
120 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>