More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0971 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0971  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 410 aa  817    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000971191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1136  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.99 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0962  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.8 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0923709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0960  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.98 
 
 		 451 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0998  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.71 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.94 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.477524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3310  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.13 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.899565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.13 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0661425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0903  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.98 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1046  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.13 
 
 		 443 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0103787  decreased coverage  0.0000000602754 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.01 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.650391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1184  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.95 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000204696  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0248  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.58 
 
 		 428 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.87 
 
 		 480 aa  316  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.81 
 
 		 438 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.97 
 
 		 494 aa  312  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  45.6 
 
 		 495 aa  308  8e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.91 
 
 		 522 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.67 
 
 		 477 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  43.52 
 
 		 445 aa  305  9.000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.09 
 
 		 480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.98 
 
 		 522 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.1 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.17 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.11 
 
 		 491 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  45.38 
 
 		 527 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.56 
 
 		 486 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  46.56 
 
 		 486 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.56 
 
 		 486 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  45.87 
 
 		 429 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.99 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.59 
 
 		 581 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  46.3 
 
 		 484 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.03 
 
 		 479 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.03 
 
 		 480 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.33 
 
 		 550 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.06 
 
 		 578 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.06 
 
 		 577 aa  300  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.72 
 
 		 443 aa  299  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.68 
 
 		 599 aa  299  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.6 
 
 		 549 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.84 
 
 		 515 aa  299  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.84 
 
 		 515 aa  299  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.48 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2535  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.65 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.41 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  42.76 
 
 		 540 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3364  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.55 
 
 		 419 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.07 
 
 		 535 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.53 
 
 		 545 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  41.81 
 
 		 639 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7264  DEAD/DEAH box helicase  44.95 
 
 		 481 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.68 
 
 		 425 aa  295  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7154  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.95 
 
 		 479 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.557352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  45.91 
 
 		 543 aa  295  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.09 
 
 		 624 aa  295  9e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.65 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5193  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.21 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0459636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.8 
 
 		 578 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.8 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  45.5 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  44.25 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  44.25 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  45.5 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4569  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.95 
 
 		 483 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5967  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.95 
 
 		 477 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.68 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  45.5 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.06 
 
 		 598 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  40.71 
 
 		 557 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4766  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.5 
 
 		 443 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2438  DEAD/DEAH box helicase-like  42.54 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5192  DEAD/DEAH box helicase-like  44.68 
 
 		 507 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.59 
 
 		 571 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.79 
 
 		 627 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.68 
 
 		 507 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.110628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.49 
 
 		 463 aa  292  8e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44 
 
 		 525 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  41.73 
 
 		 635 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44 
 
 		 526 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44 
 
 		 515 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.79 
 
 		 626 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.24 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00424195  normal  0.0145877 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1015  DEAD/DEAH box helicase-like  44.03 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100482  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  39.22 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44 
 
 		 525 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  44 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.97 
 
 		 443 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.79 
 
 		 630 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  43.01 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  44.59 
 
 		 579 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6264  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.68 
 
 		 511 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.15 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.19 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.46 
 
 		 533 aa  290  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.12 
 
 		 482 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01406  hypothetical protein  41.99 
 
 		 411 aa  288  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  46.35 
 
 		 473 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.14 
 
 		 488 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.3 
 
 		 626 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>