More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3832 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4014  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  96.71 
 
 		 335 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0637146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3954  regulatory protein LacI  96.71 
 
 		 335 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3832  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0370934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3910  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  95.81 
 
 		 335 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3845  transcriptional regulator, LacI-family  96.11 
 
 		 335 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587178  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3841  regulatory protein LacI  43.64 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0673  regulatory protein, LacI  44.89 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.371597  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4528  LacI family transcription regulator  43.98 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  31.93 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4733  transcriptional regulator, LacI family  32.09 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2555  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679604  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0809  transcriptional regulator, LacI family  31.41 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2322  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131448  normal  0.0414369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3847  transcriptional regulator, LacI family  30.54 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1554  LacI family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4547  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6174  transcriptional regulator, LacI-family  27.43 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 350 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  25.39 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32 
 
 		 348 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  29.29 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  29.2 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  28.71 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 346 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  29.76 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  29.38 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  29.11 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  30.43 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  26.57 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  28.98 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  28.4 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  29.64 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  29.64 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4583  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 343 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0718425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 340 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  28.3 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  29.78 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  29.24 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  26.47 
 
 		 343 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  27.19 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.96 
 
 		 335 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  30.75 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  28.03 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 		 332 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  30.97 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  25.15 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  28.75 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  26.04 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 340 aa  95.9  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0629  LacI family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  26.2 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  27.89 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  28.07 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  29.36 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  28.19 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4990  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0202864 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  30.55 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  26.6 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.9 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  29.59 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  28.96 
 
 		 342 aa  92.8  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  30.11 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5857  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.55822 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 		 386 aa  92.8  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  28.89 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1259  alanine racemase  24.06 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  30.77 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  26.8 
 
 		 342 aa  92.8  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  23.55 
 
 		 344 aa  92.4  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 		 336 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  28.41 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  26.82 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  26.19 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.19 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.43 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  29.63 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>