More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3580 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  99.4 
 
 		 344 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  100 
 
 		 332 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  99.7 
 
 		 344 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  99.4 
 
 		 332 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  99.1 
 
 		 332 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  83.44 
 
 		 328 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  83.74 
 
 		 334 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  83.44 
 
 		 328 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  83.44 
 
 		 328 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  83.44 
 
 		 328 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  83.74 
 
 		 334 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  83.44 
 
 		 328 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  82.82 
 
 		 328 aa  577  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  82.82 
 
 		 328 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  79.22 
 
 		 332 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  71.6 
 
 		 326 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  71.91 
 
 		 331 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  71.6 
 
 		 331 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  71.6 
 
 		 331 aa  490  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  68.81 
 
 		 332 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  68.81 
 
 		 332 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  56.31 
 
 		 324 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  53.85 
 
 		 325 aa  364  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  52.15 
 
 		 329 aa  342  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  48.8 
 
 		 327 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  48.32 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  44.79 
 
 		 332 aa  299  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  34.93 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  34.35 
 
 		 326 aa  192  8e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  34.59 
 
 		 322 aa  175  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  32.14 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.2 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  29.15 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  27.79 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  29.93 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  26.06 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  27.53 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  26.06 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  35.06 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  26.88 
 
 		 379 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  24.38 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  24.69 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  33.51 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 362 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  26.87 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 		 328 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 		 370 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25.74 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 667 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  29.69 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  21.58 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 360 aa  89.4  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 665 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  27.95 
 
 		 670 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  21.93 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  25.39 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 348 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  30.84 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  26.35 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.67 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>