More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0962 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  99.32 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  48.65 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 302 aa  315  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 295 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 296 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  42.27 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  41.92 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  40.55 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 297 aa  251  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 303 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  41.1 
 
 		 296 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.06 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 310 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 296 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  37.76 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  37.88 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 293 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 311 aa  208  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 321 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0011  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3810  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 372 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  34.92 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1291  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0519427  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>