More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3398 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 442 aa  917    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  68.11 
 
 		 447 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  77.8 
 
 		 446 aa  720    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  67.12 
 
 		 446 aa  624  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  63.78 
 
 		 443 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  59.23 
 
 		 442 aa  534  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  46.81 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 473 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  39.87 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  39.55 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  39.33 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 464 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 464 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  39.41 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  38.8 
 
 		 462 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  38.38 
 
 		 479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 469 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 		 473 aa  289  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 		 462 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 		 499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 445 aa  223  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 		 426 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  31.74 
 
 		 430 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  32.73 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 430 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  31.25 
 
 		 424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 442 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  31.28 
 
 		 430 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 445 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  29.41 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.41 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.41 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.41 
 
 		 426 aa  160  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 426 aa  160  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.41 
 
 		 426 aa  160  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.41 
 
 		 426 aa  160  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.26 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.64 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 422 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  32.28 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  29.87 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  32.65 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.82 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.36 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5272  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>