187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3323 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  681    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  78.02 
 
 		 326 aa  548  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  77.54 
 
 		 326 aa  545  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  77.23 
 
 		 326 aa  545  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  69.35 
 
 		 326 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  69.66 
 
 		 326 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  68.42 
 
 		 326 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  66.77 
 
 		 325 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  66.46 
 
 		 325 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  67.49 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  66.15 
 
 		 325 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  65.53 
 
 		 325 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  64.92 
 
 		 325 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  65.53 
 
 		 326 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  66.46 
 
 		 325 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  65.84 
 
 		 325 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  64.4 
 
 		 325 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  65.22 
 
 		 325 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  66.77 
 
 		 325 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  65.84 
 
 		 325 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  65.22 
 
 		 325 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  66.15 
 
 		 325 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  66.15 
 
 		 325 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  64.31 
 
 		 325 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  64.31 
 
 		 325 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  65.23 
 
 		 325 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  64 
 
 		 325 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  65.62 
 
 		 325 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  63.44 
 
 		 323 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  64.06 
 
 		 325 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  64.09 
 
 		 325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  63.98 
 
 		 325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  63.44 
 
 		 325 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  63.12 
 
 		 325 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  66.67 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  64 
 
 		 325 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  62.77 
 
 		 325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  63.44 
 
 		 325 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  63.38 
 
 		 325 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  65.71 
 
 		 319 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  63.69 
 
 		 325 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  64.92 
 
 		 326 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  61.8 
 
 		 325 aa  441  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  63.8 
 
 		 329 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  61.76 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  60.87 
 
 		 325 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  62.19 
 
 		 325 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  60.5 
 
 		 325 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  61.88 
 
 		 325 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  60.94 
 
 		 325 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  64.69 
 
 		 326 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  65.62 
 
 		 293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  56.56 
 
 		 323 aa  391  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  55.91 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  54.63 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  55.27 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  55.41 
 
 		 327 aa  362  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  54.95 
 
 		 327 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  54.63 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  55.59 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  54.32 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  55.59 
 
 		 325 aa  349  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.99 
 
 		 325 aa  345  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  54.31 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  53.27 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  53.99 
 
 		 325 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  54.31 
 
 		 325 aa  336  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  52.08 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  53.04 
 
 		 325 aa  330  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  66.08 
 
 		 238 aa  316  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  45.45 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  47.38 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  46.95 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  54.44 
 
 		 271 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  49.16 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  48.97 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  43.19 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  43.87 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  43.2 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  42.81 
 
 		 345 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  40.88 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  60.68 
 
 		 208 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  67.96 
 
 		 186 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  40.71 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  43.12 
 
 		 349 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  40.47 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  40.83 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  40.77 
 
 		 341 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  40.71 
 
 		 344 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  43.79 
 
 		 329 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  40.77 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  40.06 
 
 		 344 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  65 
 
 		 198 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  65 
 
 		 198 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  39.53 
 
 		 344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  41.32 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  40.41 
 
 		 344 aa  258  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  39.82 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  69.01 
 
 		 186 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  40.62 
 
 		 341 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>