46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1503 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1503  ATPase  100 
 
 		 674 aa  1372    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6179  peptidase M12A astacin  60.69 
 
 		 615 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0299292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  60.38 
 
 		 463 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  42.48 
 
 		 768 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  42.68 
 
 		 873 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  44.96 
 
 		 748 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  45.53 
 
 		 912 aa  101  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  41.04 
 
 		 818 aa  98.6  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.5 
 
 		 524 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  35.94 
 
 		 552 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.33 
 
 		 1246 aa  82  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  31.32 
 
 		 1042 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  22.99 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  31.67 
 
 		 480 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  31.98 
 
 		 1363 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.8 
 
 		 159 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  32 
 
 		 159 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4066  F5/8 type C domain-containing protein  29.6 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4065  F5/8 type C domain-containing protein  28.8 
 
 		 159 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0097  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.8 
 
 		 159 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  29.05 
 
 		 4433 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.71 
 
 		 986 aa  60.1  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  30.48 
 
 		 2068 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  29.95 
 
 		 1380 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  28.64 
 
 		 1363 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  29.03 
 
 		 644 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  25.18 
 
 		 3507 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2547  translation initiation factor SUI1  34.48 
 
 		 611 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.858491  hitchhiker  0.00146085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  24.73 
 
 		 779 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  27.82 
 
 		 999 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  25.69 
 
 		 861 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  25.93 
 
 		 1973 aa  50.8  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  25.26 
 
 		 801 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  27.48 
 
 		 670 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.87 
 
 		 1362 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  32.86 
 
 		 340 aa  47.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  38.03 
 
 		 409 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.41 
 
 		 1448 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.2 
 
 		 2334 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  27 
 
 		 836 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  24.62 
 
 		 1735 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  31.65 
 
 		 715 aa  44.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  23.64 
 
 		 3333 aa  44.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.63 
 
 		 756 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  27 
 
 		 1067 aa  43.9  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.61 
 
 		 1117 aa  43.9  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>