129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2295 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 578 aa  1197    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  97.06 
 
 		 577 aa  1156    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  96.71 
 
 		 570 aa  1151    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  25.17 
 
 		 565 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  24.49 
 
 		 989 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 609 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  23.87 
 
 		 594 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  23.87 
 
 		 594 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  23.87 
 
 		 594 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13759  oxidoreductase  23.18 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649685  normal  0.108342 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1394  hypothetical protein  23.27 
 
 		 530 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.57 
 
 		 647 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.57 
 
 		 647 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  44.44 
 
 		 462 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  38.46 
 
 		 644 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  56.1 
 
 		 598 aa  52  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  36 
 
 		 645 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  31.76 
 
 		 465 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  38.96 
 
 		 461 aa  51.6  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  30.58 
 
 		 615 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0181  2,4-dienoyl-CoA reductase  44.44 
 
 		 711 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  38.71 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  35.96 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2309  hypothetical protein  53.85 
 
 		 972 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2356  hypothetical protein  53.85 
 
 		 972 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2348  hypothetical protein  53.85 
 
 		 972 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  38.71 
 
 		 516 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12040  2,4-dienoyl-CoA reductase  45.65 
 
 		 676 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.138062  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  45 
 
 		 938 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  42.62 
 
 		 526 aa  47.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  31.31 
 
 		 616 aa  47.8  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  35.29 
 
 		 528 aa  47.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  48.08 
 
 		 469 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2406  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.5 
 
 		 648 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0287125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  33.78 
 
 		 527 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  45.45 
 
 		 535 aa  47.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  46 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  28.43 
 
 		 647 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  50 
 
 		 771 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  22.73 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1799  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.96 
 
 		 681 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.921787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  41.51 
 
 		 670 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  46.94 
 
 		 615 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  38.36 
 
 		 460 aa  47  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  37.5 
 
 		 484 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1273  2,4-dienoyl-CoA reductase  33.75 
 
 		 722 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.988489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.65 
 
 		 608 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5479  Glutamate synthase (NADPH)  50 
 
 		 599 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 484 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.61 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  45.83 
 
 		 413 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  48.94 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  45.83 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  53.66 
 
 		 469 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5533  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  43.64 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  41.67 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  38.6 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  43.55 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2156  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  43.4 
 
 		 667 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  35.44 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0192  2,4-dienoyl-CoA reductase  32.5 
 
 		 677 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.804371  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0995  2,4-dienoyl-CoA reductase  32.5 
 
 		 677 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1885  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.77 
 
 		 1016 aa  45.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0478  2,4-dienoyl-CoA reductase  32.5 
 
 		 689 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523998  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1367  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  32.5 
 
 		 677 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1562  2,4-dienoyl-CoA reductase  32.5 
 
 		 677 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0222  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  32.5 
 
 		 677 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.62 
 
 		 596 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.48 
 
 		 652 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.931627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06887  protoporphyrinogen  31.3 
 
 		 129 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  53.85 
 
 		 646 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  40.43 
 
 		 472 aa  45.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  44.19 
 
 		 524 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0094  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  31.25 
 
 		 673 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2118  FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 		 615 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  48.94 
 
 		 468 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  43.48 
 
 		 617 aa  45.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  46.67 
 
 		 457 aa  45.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1050  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  32.43 
 
 		 739 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0896174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  51.22 
 
 		 469 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1598  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.25 
 
 		 673 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2719  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  32.5 
 
 		 677 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1515  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.25 
 
 		 673 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0916177  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2575  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  32.5 
 
 		 677 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0494  glutamate synthase subunit beta  45.65 
 
 		 487 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0118721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  38.16 
 
 		 448 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 		 769 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0507  glutamate synthase subunit beta  45.65 
 
 		 487 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  30.68 
 
 		 520 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  27.27 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  44.44 
 
 		 533 aa  44.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31 
 
 		 677 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  41.67 
 
 		 448 aa  44.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  41.67 
 
 		 471 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  45.24 
 
 		 599 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  43.48 
 
 		 477 aa  44.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.62 
 
 		 643 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0797  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.29 
 
 		 676 aa  44.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369713  normal  0.316653 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>