125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3178 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  100 
 
 
543 aa  1140    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  71.78 
 
 
525 aa  815    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  96.5 
 
 
543 aa  1103    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  97.24 
 
 
543 aa  1107    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  96.5 
 
 
543 aa  1103    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  68.96 
 
 
528 aa  780    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  51.79 
 
 
514 aa  561  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  49.63 
 
 
520 aa  531  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  49.16 
 
 
517 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  49.54 
 
 
524 aa  524  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  47.32 
 
 
522 aa  519  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  47.49 
 
 
524 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  47.39 
 
 
514 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  48.23 
 
 
526 aa  511  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  45.68 
 
 
520 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  46.03 
 
 
537 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  45.72 
 
 
517 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  46.14 
 
 
508 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  45.6 
 
 
531 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  45.3 
 
 
505 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  43.37 
 
 
518 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  44.23 
 
 
527 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  41.96 
 
 
524 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  41.18 
 
 
513 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  39.21 
 
 
513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  39.21 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  38.84 
 
 
513 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  39.18 
 
 
524 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  38.43 
 
 
522 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  39.85 
 
 
507 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  38.1 
 
 
532 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  37.69 
 
 
507 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  36.69 
 
 
508 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  36.43 
 
 
508 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  36.53 
 
 
508 aa  346  8e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  36.75 
 
 
507 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  36.98 
 
 
507 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  35.98 
 
 
515 aa  339  9e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  35.88 
 
 
507 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  35.92 
 
 
510 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  35.83 
 
 
537 aa  329  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  36.04 
 
 
511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  34.17 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  33.26 
 
 
501 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.54 
 
 
517 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  30.73 
 
 
508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  32.75 
 
 
515 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.27 
 
 
498 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.46 
 
 
499 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  31.09 
 
 
504 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33.66 
 
 
499 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  32.79 
 
 
497 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  30.55 
 
 
508 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
512 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.27 
 
 
499 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  30.53 
 
 
505 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
507 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  31.38 
 
 
501 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  33.27 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  29.57 
 
 
503 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  31.18 
 
 
492 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.86 
 
 
502 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.36 
 
 
509 aa  217  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  29.85 
 
 
511 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  28.63 
 
 
529 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  32.54 
 
 
505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  28.63 
 
 
529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  30.02 
 
 
497 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  31.95 
 
 
502 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  28.26 
 
 
538 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  32.6 
 
 
518 aa  210  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  29.35 
 
 
496 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  31.53 
 
 
502 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.96 
 
 
506 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  29.46 
 
 
496 aa  207  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  31.35 
 
 
494 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  29.57 
 
 
501 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  28.18 
 
 
506 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  28.75 
 
 
500 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  28.6 
 
 
538 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  28.23 
 
 
538 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  28.6 
 
 
538 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  29.8 
 
 
523 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  32.79 
 
 
503 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  27.74 
 
 
538 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  30.74 
 
 
504 aa  199  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  30.28 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  31.13 
 
 
501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  30.79 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  28.76 
 
 
740 aa  198  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  31.48 
 
 
498 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  31.28 
 
 
501 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  31.7 
 
 
499 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  27.55 
 
 
538 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  29.11 
 
 
537 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  29.88 
 
 
504 aa  196  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  31.39 
 
 
502 aa  196  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  28.84 
 
 
510 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  30.23 
 
 
497 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  31.25 
 
 
501 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>