124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2945 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  100 
 
 
501 aa  1050    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  98.4 
 
 
501 aa  1035    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  97.42 
 
 
503 aa  1013    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  98 
 
 
499 aa  1015    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  41.87 
 
 
517 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  41.58 
 
 
506 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  42.08 
 
 
502 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  42.15 
 
 
498 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  34.51 
 
 
506 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
509 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  35.1 
 
 
502 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  36.19 
 
 
501 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  33 
 
 
507 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  33.53 
 
 
505 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  34.91 
 
 
505 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  36.3 
 
 
503 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  34.95 
 
 
501 aa  256  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  34.95 
 
 
501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  34.27 
 
 
515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  35.32 
 
 
510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.73 
 
 
499 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  38.05 
 
 
507 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  35.78 
 
 
518 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  33.13 
 
 
501 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33.53 
 
 
499 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  32.01 
 
 
505 aa  249  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
499 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  33.69 
 
 
502 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  33.92 
 
 
507 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  35.68 
 
 
509 aa  243  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  33.26 
 
 
505 aa  242  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  35.25 
 
 
511 aa  242  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  35.06 
 
 
498 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  34.26 
 
 
512 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  31.08 
 
 
504 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  33.73 
 
 
510 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  31.06 
 
 
538 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  32.72 
 
 
527 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  33.49 
 
 
504 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  32.69 
 
 
503 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  36.67 
 
 
511 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  31.22 
 
 
511 aa  237  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  34.39 
 
 
513 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  30.85 
 
 
538 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  34.39 
 
 
513 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  34.39 
 
 
513 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  32.37 
 
 
514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  32.14 
 
 
497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  31.07 
 
 
504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.73 
 
 
497 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  31.29 
 
 
538 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
501 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  33.05 
 
 
740 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  32.3 
 
 
538 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  31.08 
 
 
538 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.41 
 
 
529 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.41 
 
 
529 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  33.66 
 
 
515 aa  233  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  33.26 
 
 
538 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  33.18 
 
 
518 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  31.97 
 
 
500 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  30.1 
 
 
500 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.18 
 
 
537 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  33.26 
 
 
496 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  34.41 
 
 
502 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  34.02 
 
 
497 aa  227  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  31.84 
 
 
495 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.32 
 
 
508 aa  226  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.92 
 
 
492 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  34.85 
 
 
513 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.79 
 
 
494 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.43 
 
 
508 aa  223  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  31.56 
 
 
503 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  31.56 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  31.35 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  31.35 
 
 
503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  33.18 
 
 
496 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.59 
 
 
507 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  32.95 
 
 
510 aa  220  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  32.04 
 
 
503 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  33.26 
 
 
525 aa  219  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  33.48 
 
 
532 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.7 
 
 
524 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  31.57 
 
 
506 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  33.41 
 
 
508 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  31.67 
 
 
496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  34.23 
 
 
524 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  32.71 
 
 
497 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  29.82 
 
 
514 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  30.97 
 
 
505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  33.86 
 
 
505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  31.58 
 
 
526 aa  216  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  34.01 
 
 
508 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  30.77 
 
 
537 aa  214  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  32.48 
 
 
499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  31.77 
 
 
543 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  31.77 
 
 
543 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
522 aa  209  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  32.3 
 
 
507 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  31.78 
 
 
543 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>