More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0190 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0190  surface presentation of antigens protein SpaS  100 
 
 
342 aa  685    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  51.61 
 
 
373 aa  352  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3040  surface presentation of antigens protein SpaS  49.12 
 
 
356 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3077  surface presentation of antigens protein SpaS  49.12 
 
 
356 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3197  surface presentation of antigens protein SpaS  49.12 
 
 
356 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3092  surface presentation of antigens protein SpaS  49.12 
 
 
356 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000792926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3009  surface presentation of antigens protein SpaS  49.12 
 
 
356 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2076  surface presentation of antigens protein SpaS  40.52 
 
 
411 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1533  surface presentation of antigens protein SpaS  40.52 
 
 
411 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0573  surface presentation of antigens protein SpaS  40.52 
 
 
411 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2071  surface presentation of antigens protein SpaS  40.52 
 
 
411 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.086614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2164  surface presentation of antigens protein SpaS  40.52 
 
 
406 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0751  surface presentation of antigens protein SpaS  40.52 
 
 
411 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0839  surface presentation of antigens protein SpaS  40.88 
 
 
381 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3181  FlhB/HrpN/YscU/SpaS family protein  44.87 
 
 
243 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  32.66 
 
 
354 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  31.12 
 
 
349 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  31.05 
 
 
351 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  27.35 
 
 
346 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  29.39 
 
 
346 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  33.61 
 
 
349 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  31.94 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  30.49 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  29.64 
 
 
360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  27.86 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.86 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  27.49 
 
 
359 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.01 
 
 
383 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  28.77 
 
 
352 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  28.77 
 
 
352 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  28.77 
 
 
352 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  28.77 
 
 
352 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.48 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  28.77 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  28.01 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  28.41 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  30.98 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  28.48 
 
 
356 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  28.48 
 
 
355 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.64 
 
 
374 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.64 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.38 
 
 
363 aa  129  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  27.81 
 
 
359 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.49 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  26.97 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3014  hypothetical protein  62.5 
 
 
120 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000371086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  26 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  27.93 
 
 
359 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  26.04 
 
 
361 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.36 
 
 
381 aa  126  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.99 
 
 
384 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.64 
 
 
378 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.65 
 
 
368 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.94 
 
 
354 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.56 
 
 
357 aa  123  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.62 
 
 
357 aa  123  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.35 
 
 
378 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.1 
 
 
362 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  24.92 
 
 
377 aa  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  24.93 
 
 
357 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.27 
 
 
362 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.07 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  26.35 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.94 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.57 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.57 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  25.72 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.98 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.96 
 
 
390 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.45 
 
 
377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.65 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.07 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  28.86 
 
 
357 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  23.45 
 
 
359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0043  type III secretion exporter  28.82 
 
 
352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.61 
 
 
377 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.61 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  25.29 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  24.34 
 
 
399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  24.34 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  25.29 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  25.77 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  25.14 
 
 
377 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.9 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  25.29 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.21 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  25.29 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.3 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.75 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  23.77 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  24.43 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.71 
 
 
353 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.69 
 
 
356 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  24.69 
 
 
376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.08 
 
 
379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  25.45 
 
 
360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.98 
 
 
376 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.17 
 
 
353 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  24.08 
 
 
383 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  24.08 
 
 
383 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>