181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3014 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3014  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  243  8e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000371086  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  94.17 
 
 
373 aa  234  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3197  surface presentation of antigens protein SpaS  66.67 
 
 
356 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3009  surface presentation of antigens protein SpaS  66.67 
 
 
356 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3092  surface presentation of antigens protein SpaS  66.67 
 
 
356 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000792926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3077  surface presentation of antigens protein SpaS  66.67 
 
 
356 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3040  surface presentation of antigens protein SpaS  66.67 
 
 
356 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110418 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0190  surface presentation of antigens protein SpaS  62.5 
 
 
342 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1533  surface presentation of antigens protein SpaS  49.49 
 
 
411 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0573  surface presentation of antigens protein SpaS  49.49 
 
 
411 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2071  surface presentation of antigens protein SpaS  49.49 
 
 
411 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.086614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2164  surface presentation of antigens protein SpaS  49.49 
 
 
406 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0751  surface presentation of antigens protein SpaS  49.49 
 
 
411 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0839  surface presentation of antigens protein SpaS  47.52 
 
 
381 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2076  surface presentation of antigens protein SpaS  49.49 
 
 
411 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  36.78 
 
 
351 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  35.23 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  36.78 
 
 
349 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  40.96 
 
 
354 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  33.33 
 
 
420 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  33.33 
 
 
420 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  32.58 
 
 
360 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  32.18 
 
 
420 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  32.18 
 
 
399 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  32.18 
 
 
420 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  31.46 
 
 
360 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.1 
 
 
354 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.1 
 
 
353 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.1 
 
 
353 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  39.66 
 
 
359 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  39.66 
 
 
359 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  31.46 
 
 
359 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.38 
 
 
354 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.33 
 
 
363 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.03 
 
 
359 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  34.57 
 
 
345 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  30.21 
 
 
357 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.08 
 
 
379 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.46 
 
 
360 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.26 
 
 
379 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37481  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.08 
 
 
379 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  23.15 
 
 
379 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.85 
 
 
376 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.85 
 
 
377 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  26.74 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.85 
 
 
376 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.85 
 
 
376 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  30.12 
 
 
349 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  30.12 
 
 
349 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0762  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.93 
 
 
360 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.28 
 
 
376 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.85 
 
 
376 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.85 
 
 
376 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  32.76 
 
 
352 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0214  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.93 
 
 
379 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.772571  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
348 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.226295  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  32.76 
 
 
352 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  32.76 
 
 
352 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.76 
 
 
354 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
348 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1556  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
348 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1545  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
348 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3609  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
348 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1766  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
348 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1715  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.76 
 
 
348 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  34.48 
 
 
359 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1844  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
348 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0972714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.65 
 
 
379 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.93 
 
 
376 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1735  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
348 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.736219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  25.29 
 
 
346 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0164  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.65 
 
 
379 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2594  type III secretion exporter  31.03 
 
 
355 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1359  type III secretion exporter  31.03 
 
 
355 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3256  flagellar biosynthesis protein FlhB  35 
 
 
362 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.48 
 
 
356 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2498  type III secretion exporter  31.03 
 
 
355 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116579  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
356 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.85 
 
 
376 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  35 
 
 
375 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0158  type III secretion exporter  30.51 
 
 
390 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.93 
 
 
377 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0307  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.21 
 
 
363 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1153  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.21 
 
 
356 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.66 
 
 
363 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
356 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  35 
 
 
360 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  24.07 
 
 
376 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.93 
 
 
376 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.93 
 
 
377 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.66 
 
 
376 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0022  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.66 
 
 
359 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  25 
 
 
376 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  24.44 
 
 
360 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  31.67 
 
 
377 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.51 
 
 
366 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.03 
 
 
348 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  31.67 
 
 
381 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0932  type III secretion exporter  30.51 
 
 
387 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.76 
 
 
361 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>