More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0691 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  66.21 
 
 		 289 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  55.71 
 
 		 327 aa  352  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  44.56 
 
 		 285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  42.36 
 
 		 359 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  41.4 
 
 		 289 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 		 340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  31.31 
 
 		 349 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 		 296 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  31.31 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  32.89 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  30.64 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  31.65 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  27.95 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  29.69 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  27.68 
 
 		 282 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  27.68 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  28.42 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.01 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  45.05 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1389  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 325 aa  82  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  26.54 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  25.59 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  27.82 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  25.59 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>