150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0208 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
248 aa  497  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  57.02 
 
 
254 aa  242  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  55.27 
 
 
244 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  46.38 
 
 
256 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  48.12 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  43.15 
 
 
257 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  44.25 
 
 
274 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  44.21 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  45.02 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  43.67 
 
 
277 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  44.21 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  42.4 
 
 
290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  37.39 
 
 
253 aa  160  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  41.52 
 
 
272 aa  158  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  41.63 
 
 
259 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  41.39 
 
 
263 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  43.18 
 
 
257 aa  155  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  44.07 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  42.42 
 
 
254 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  42.42 
 
 
248 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  41.84 
 
 
647 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  41.74 
 
 
249 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  44.21 
 
 
265 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  32.93 
 
 
260 aa  151  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  42.08 
 
 
271 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  43.04 
 
 
264 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  43.59 
 
 
264 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  41.67 
 
 
283 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  43.11 
 
 
252 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  38.91 
 
 
251 aa  148  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  40.62 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  41.99 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  39.47 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  36.47 
 
 
259 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  40.83 
 
 
269 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  33.47 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  43.11 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  41.13 
 
 
249 aa  138  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  38.1 
 
 
255 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  42.54 
 
 
265 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  42.34 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  30.77 
 
 
279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  35.4 
 
 
276 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  35.4 
 
 
276 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  30.6 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
275 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  27.32 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  27.31 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.18 
 
 
261 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.52 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  40 
 
 
334 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.64 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  21.86 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  41.43 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
308 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  27.56 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  41.25 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  32.06 
 
 
239 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  28.79 
 
 
397 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
253 aa  48.9  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.65 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  22.65 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2065  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.72 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
266 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
265 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  38.46 
 
 
402 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.19 
 
 
368 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  30 
 
 
277 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  24.26 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  27.96 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
277 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40 
 
 
374 aa  46.2  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0821  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
252 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.19 
 
 
368 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  30.82 
 
 
201 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.19 
 
 
368 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  28.26 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  40 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1534  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
263 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
265 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
300 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  28.7 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  28.7 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  35.58 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.66 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  26.44 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  39.6 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.84 
 
 
370 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  29.17 
 
 
510 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0803  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 
353 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>